MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium variabile DSM 44702 chromosome

Total Repeats: 78534

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015859	CGC	2	6	66	71	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792957
2	NC_015859	CCG	2	6	74	79	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792957
3	NC_015859	CAG	2	6	118	123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792957
4	NC_015859	GTC	2	6	133	138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792957
5	NC_015859	CACCG	2	10	162	171	20 %	0 %	20 %	60 %	340792957
6	NC_015859	GTAC	2	8	181	188	25 %	25 %	25 %	25 %	340792957
7	NC_015859	AGA	2	6	197	202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340792957
8	NC_015859	CA	3	6	212	217	50 %	0 %	0 %	50 %	340792957
9	NC_015859	CGC	2	6	282	287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792957
10	NC_015859	GCCG	2	8	309	316	0 %	0 %	50 %	50 %	340792957
11	NC_015859	GCC	2	6	339	344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792957
12	NC_015859	GAG	2	6	376	381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340792957
13	NC_015859	TCC	2	6	391	396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340792957
14	NC_015859	GAC	2	6	463	468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792957
15	NC_015859	TCC	2	6	526	531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340792957
16	NC_015859	GCC	2	6	532	537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792957
17	NC_015859	CCG	2	6	593	598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792957
18	NC_015859	CCG	2	6	614	619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792957
19	NC_015859	GCCG	2	8	627	634	0 %	0 %	50 %	50 %	340792957
20	NC_015859	CCG	3	9	632	640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792957
21	NC_015859	CGA	3	9	651	659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792957
22	NC_015859	CGC	2	6	723	728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792957
23	NC_015859	TCA	2	6	902	907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340792957
24	NC_015859	CGCTCG	2	12	926	937	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	340792957
25	NC_015859	CCT	2	6	969	974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340792957
26	NC_015859	TCG	2	6	977	982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792957
27	NC_015859	TCC	2	6	995	1000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340792957
28	NC_015859	AGG	2	6	1019	1024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340792957
29	NC_015859	TTC	2	6	1027	1032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340792957
30	NC_015859	CCG	2	6	1090	1095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792957
31	NC_015859	GAC	2	6	1104	1109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792957
32	NC_015859	GGA	2	6	1113	1118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340792957
33	NC_015859	GGGC	2	8	1140	1147	0 %	0 %	75 %	25 %	340792957
34	NC_015859	CAC	2	6	1149	1154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340792957
35	NC_015859	AAG	2	6	1201	1206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340792957
36	NC_015859	GGC	2	6	1221	1226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340792957
37	NC_015859	TCC	2	6	1270	1275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340792957
38	NC_015859	GTG	2	6	1306	1311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340792957
39	NC_015859	CGC	2	6	1347	1352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792957
40	NC_015859	GGT	3	9	1359	1367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340792957
41	NC_015859	TCGA	2	8	1444	1451	25 %	25 %	25 %	25 %	340792957
42	NC_015859	CGA	3	9	1538	1546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792957
43	NC_015859	CGG	2	6	1563	1568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340792957
44	NC_015859	ACCAC	2	10	1574	1583	40 %	0 %	0 %	60 %	340792957
45	NC_015859	GAA	2	6	1599	1604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340792957
46	NC_015859	AGA	2	6	1664	1669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340792957
47	NC_015859	CG	4	8	1678	1685	0 %	0 %	50 %	50 %	340792957
48	NC_015859	ACC	2	6	2485	2490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340792958
49	NC_015859	CAG	2	6	2506	2511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792958
50	NC_015859	GAC	2	6	2536	2541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792958
51	NC_015859	GTG	2	6	2606	2611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340792958
52	NC_015859	CCA	2	6	2669	2674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340792958
53	NC_015859	GGCC	2	8	2721	2728	0 %	0 %	50 %	50 %	340792958
54	NC_015859	CAT	2	6	2742	2747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340792958
55	NC_015859	ACG	2	6	2783	2788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792958
56	NC_015859	CGA	2	6	2847	2852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792958
57	NC_015859	TCC	2	6	2861	2866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340792958
58	NC_015859	CCG	2	6	2882	2887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792958
59	NC_015859	TCA	2	6	2918	2923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340792958
60	NC_015859	GTCGCC	2	12	2929	2940	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	340792958
61	NC_015859	GCCG	2	8	2941	2948	0 %	0 %	50 %	50 %	340792958
62	NC_015859	GAC	2	6	2950	2955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792958
63	NC_015859	CGC	2	6	3012	3017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792958
64	NC_015859	ACCG	2	8	3019	3026	25 %	0 %	25 %	50 %	340792958
65	NC_015859	CCCG	2	8	3061	3068	0 %	0 %	25 %	75 %	340792958
66	NC_015859	CCG	2	6	3080	3085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792958
67	NC_015859	GCT	2	6	3087	3092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792958
68	NC_015859	CGC	2	6	3174	3179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792958
69	NC_015859	CGG	2	6	3183	3188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340792958
70	NC_015859	TCCG	2	8	3263	3270	0 %	25 %	25 %	50 %	340792958
71	NC_015859	CTG	2	6	3271	3276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792958
72	NC_015859	GCT	2	6	3318	3323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792958
73	NC_015859	CCG	2	6	3333	3338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792958
74	NC_015859	CGG	2	6	3408	3413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340792958
75	NC_015859	GAG	2	6	3436	3441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340792958
76	NC_015859	TCG	2	6	3458	3463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792958
77	NC_015859	ACCG	2	8	3526	3533	25 %	0 %	25 %	50 %	340792958
78	NC_015859	GTC	2	6	3535	3540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792958
79	NC_015859	CCCG	2	8	3560	3567	0 %	0 %	25 %	75 %	340792958
80	NC_015859	CCCGAG	2	12	3580	3591	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	340792958
81	NC_015859	AGGC	2	8	3602	3609	25 %	0 %	50 %	25 %	340792958
82	NC_015859	ACCT	2	8	3646	3653	25 %	25 %	0 %	50 %	340792958
83	NC_015859	TCG	2	6	3810	3815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792959
84	NC_015859	CCG	2	6	3912	3917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792959
85	NC_015859	TCA	2	6	3951	3956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340792959
86	NC_015859	ACC	2	6	4034	4039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340792959
87	NC_015859	GGA	2	6	4051	4056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340792959
88	NC_015859	GTC	2	6	4109	4114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792959
89	NC_015859	CG	3	6	4117	4122	0 %	0 %	50 %	50 %	340792959
90	NC_015859	CTG	2	6	4184	4189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792959
91	NC_015859	CGT	2	6	4197	4202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792959
92	NC_015859	CGGTGG	2	12	4206	4217	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	340792959
93	NC_015859	CGG	2	6	4258	4263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340792959
94	NC_015859	GAG	2	6	4316	4321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340792959
95	NC_015859	CGGC	2	8	4349	4356	0 %	0 %	50 %	50 %	340792959
96	NC_015859	CGG	2	6	4414	4419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340792959
97	NC_015859	ACCT	2	8	4421	4428	25 %	25 %	0 %	50 %	340792959
98	NC_015859	TGC	2	6	4455	4460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792959
99	NC_015859	GAC	2	6	4529	4534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792959
100	NC_015859	GCCA	2	8	4574	4581	25 %	0 %	25 %	50 %	340792959
101	NC_015859	CGA	2	6	4669	4674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792959
102	NC_015859	CGC	2	6	4700	4705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792959
103	NC_015859	TCG	2	6	4713	4718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792959
104	NC_015859	TCA	2	6	4746	4751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340792959
105	NC_015859	CCG	3	9	4752	4760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792959
106	NC_015859	CGA	2	6	4762	4767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792959
107	NC_015859	CCG	2	6	4776	4781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792959
108	NC_015859	GC	3	6	4813	4818	0 %	0 %	50 %	50 %	340792959
109	NC_015859	GACG	2	8	4832	4839	25 %	0 %	50 %	25 %	340792959
110	NC_015859	TGA	2	6	4861	4866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340792959
111	NC_015859	CGC	2	6	4886	4891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792960
112	NC_015859	GAA	2	6	4928	4933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340792960
113	NC_015859	CGA	2	6	4940	4945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792960
114	NC_015859	CGAAGC	2	12	5002	5013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792960
115	NC_015859	ACG	2	6	5029	5034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792960
116	NC_015859	CGGT	2	8	5063	5070	0 %	25 %	50 %	25 %	340792960
117	NC_015859	TCG	2	6	5158	5163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792960
118	NC_015859	CGCC	2	8	5174	5181	0 %	0 %	25 %	75 %	340792960
119	NC_015859	GTC	2	6	5190	5195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792960
120	NC_015859	AAGGAG	2	12	5202	5213	50 %	0 %	50 %	0 %	340792960
121	NC_015859	GAA	2	6	5297	5302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340792960
122	NC_015859	CGG	2	6	5306	5311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340792960
123	NC_015859	GTCCGC	2	12	5341	5352	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	340792960
124	NC_015859	GGCTGA	2	12	5494	5505	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	340792961
125	NC_015859	CAC	2	6	5528	5533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340792961
126	NC_015859	CCA	2	6	5619	5624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340792961
127	NC_015859	CCA	2	6	5638	5643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340792961
128	NC_015859	GAC	2	6	5723	5728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792961
129	NC_015859	GTC	2	6	5804	5809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792961
130	NC_015859	CGG	2	6	5827	5832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340792961
131	NC_015859	GGT	2	6	5864	5869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340792961
132	NC_015859	AAG	2	6	5996	6001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340792961
133	NC_015859	CAC	2	6	6016	6021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340792961
134	NC_015859	CGC	2	6	6086	6091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792961
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256	NC_015859	TGG	2	6	11056	11061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340792965
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259	NC_015859	GCG	2	6	11183	11188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340792965
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262	NC_015859	GTC	2	6	11263	11268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792965
263	NC_015859	TCG	2	6	11276	11281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792965
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265	NC_015859	TCG	2	6	11318	11323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792965
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274	NC_015859	CAT	2	6	11712	11717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340792965
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285	NC_015859	CGG	2	6	12397	12402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340792966
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290	NC_015859	GGA	2	6	12647	12652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340792966
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292	NC_015859	GAG	2	6	12741	12746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340792966
293	NC_015859	GAG	2	6	12771	12776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340792966
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388	NC_015859	TCC	2	6	17640	17645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340792971
389	NC_015859	TCG	2	6	17665	17670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792971
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499	NC_015859	GCGTCG	2	12	23118	23129	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	340792974
500	NC_015859	CAC	2	6	23179	23184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340792974

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